Burokėlius pradedama nuimti rugsėjo trečiame dešimtadienyje. Iš visų šakniavaisių burokėliai nuimami pirmieji, nes jie jautrūs žemoms temperatūroms.
Burokėliai atsargiai pakeliami šakėmis, išraunami, rankomis nuvaloma žemė, aštriu peiliu nupjaunami lapai nepažeidžiant šakniavaisio. Kai pjūvio vieta apdžiūsta ir sukietėja, burokėliai sudedami laikymui.
Burokėlius galima laikyti dėžėse sluoksniuojant su smėliu (3-4 cm), sausomis durpėmis, pjuvenomis arba drožlėmis. Palankiausia temperatūra 2-3 °C, drėgnumas – 80-85%. Burokėlius galima laikyti polietileniniuose maišuose, šakniavaisius užbėrus smėliu arba pjuvenomis.